Les domaines de compétences des chercheurs, ingénieurs et techniciens de l'unité relèvent de plusieurs disciplines : l'écologie, l'océanographie physique et la biogéochimie marine, la géochimie et la physico-chimie de l'environnement.
Leur complémentarité permet de proposer des approches aux interfaces de ces disciplines en intégrant des méthodes et outils de ces différents domaines. Ces approches nécessitent d'adapter les méthodes classiques à la spécificité de milieux benthiques fortement hétérogènes et instables (analyse de traceurs géochimiques et biomarqueurs) et de contribuer au développement de méthodes avancées et nouveaux outils (omiques, capteurs).
L'analyse de jeux de données complexes (diversité de la macro et meiofaune benthique, des communautés de procaryotes, enregistrements de paramètres biochimiques, physico-chimiques, géochimiques) par différentes méthodes numériques permet d'élucider les mécanismes gouvernant les relations biodiversité-fonctions et leur intégration dans des modèles numérique.